Nikos Papadopoulos związał się umową z PAS Lamia 1964.
27-latek pierwsze piłkarskie kroki rozbił w szkółce Olympiakosu Pireus. W 2012 roku podpisał roczny kontrakt z niemiecką Fortuną Düsseldorf. Po powrocie do Grecji związał się z Panionios GSS (rozegrał 53 oficjalne mecze), a ostatni sezon spędził w innym stołecznym klubie Atromitosie Peristeri, w którego barwach rozegrał zaledwie pięć meczów.
